テンプレートを操作されているかと思いますが、テンプレートを操作された後、実際にどのようにHTMLが出力されているか、ご確認いただいていますでしょうか。
シムエントリの説明ページでも一部ご案内しておりますが、テンプレートやブログサービスは数多くございますため、全てを網羅し切れてはおりません。お手数かとは存じますが、ある程度ご自身で調整いただくことをお願いしております。
万一、シムエントリ側のスタイルシートに著しい問題があるようでしたら、ご連絡いただけますでしょうか。
また、記事毎のブログパーツではなく、サイトのメニューバーに取り付けるブログパーツもございます。こちらのほうが設置難易度は低いので、あわせてご検討下さい。

また、詳しく解説されている方がいらっしゃいますので、よろしければあわせてご覧下さい。
http://smartass.blog10.fc2.com/blog-entry-2258.html

前略
是非使ってみたいと思っているのですが
記事のエントリを
テンプレートに貼り付ける
ということは
記事ごとにテンプレートに貼り付けないといけないのでしょうか？

もう一つ
自分のブログは記事の最後
コメント　トラックバック
という構成になっているのでトラックバックの後ろに表示させたいのですが
その場合どこに入れれば良いでしょうか？

<%topentry_link>#comment”>comment(<%topentry_comment_num>)
<!–/allow_comment–>
<!–deny_comment–>

★（ここに入れると何故かトップ記事にしかシムエントリが表示されず）

<!–/deny_comment–>
<!–allow_tb–>

★（ここにいれると指定したエントリに表示されます）

<a href=”<%topentry_link>#trackback”>trackback(<%topentry_tb_num>)
★トラックバックの後ろに入れようと下の?部分に入れてみたのですが
表示されませんでした

<!–/allow_tb–>
?????????????????????????
<!–deny_tb–>
?????????????????????????
<!–/deny_tb–>
?????????????????????????
<div align=”right”><a href=”#top”>▲pagetop</b></a></div>

どうかよろしくお願い致します

もう一つ
自分のブログは記事の最後
コメント　トラックバック
という構成になっているのでトラックバックの後ろに表示させたいのですが
その場合どこに入れれば良いでしょうか？

#comment”>comment()

★（ここに入れると何故かトップ記事にしかシムエントリが表示されず）

★（ここにいれると指定したエントリに表示されます）

<a href=”#trackback”>trackback()
★トラックバックの後ろに入れようと下の?部分に入れてみたのですが
表示されませんでした

?????????????????????????

?????????????????????????

?????????????????????????
▲pagetop

お手数お掛けしますが回答頂けたら嬉しいです

どうかよろしくお願い致します